南管新錦珠劇團具備前、後場的戲班，並且擅長進行「九甲戲」的表演與教學。他們的演員唱腔優美，身段細膩，展現出溫婉柔美的特色，具有高度的藝術性，符合傳統藝術民俗及有關文物登錄指定及廢止辦法第2條第1項第1款第1目的登錄基準，即「具有藝術價值者」。此外，南管新錦珠劇團保存了臺灣九甲戲「南唱北打」的獨特藝術特色，表現出特殊性。他們的技法優秀，保存了九甲戲的傳統藝術元素，符合傳統藝術民俗及有關文物登錄指定及廢止辦法第2條第1項第1款第2目的登錄基準，即「構成傳統藝術之特殊藝能表現。其技法優秀者。」

該團的藝術傳承來自臺灣九甲戲王包，並在臺灣融合形成了獨特的戲曲藝術。他們的劇目、曲牌、唱腔與身段具有地方性，具有地方色彩或流派特色顯著，符合傳統藝術民俗及有關文物登錄指定及廢止辦法第2條第1項第1款第3目的登錄基準，即「傳統藝術領域有價值與地位，並具有地方色彩或流派特色顯著者。」此外，南管新錦珠劇團積極參與薪傳教學，並在彰化南北管音樂戲曲館、臺北藝術大學傳統音樂學系等地進行傳統戲曲的推廣工作，對傳統戲曲的傳承與推廣作出了積極的貢獻。