高雄代天宮創建於民國40年，其建廟緣由，溯自昭和5年(1930)，前台南縣北門鄉蚵寮村民移居哈瑪星，自故鄉「保安宮」迎請清水祖師金身蒞境護佑，由旅高鄉親輪流奉祀，以為精神寄託。
民國38年農曆4月，經信眾集會商議建造公厝以安奉諸洞天神佛，隨即恭請「南鯤身代天府」吳府千歲暨「蚵寮保安宮」池府千歲前來主持建廟事宜。
嗣後，經吳府千歲起駕指示，擇點廟地建廟，並命名為「高雄代天宮」，奉祀「南鯤身」五府千歲、「蚵寮保安宮」池府千歲及清水祖師等神尊。
「高雄代天宮」肇建於民國40年(1951)，為戰後初期之典型台灣廟宇型式，本體為傳統閩式建築，格局嚴謹包括三川五門、前拜殿、正殿、後殿、左右護龍等，且廟方保存有潘麗水之彩繪、葉經義之木雕、蔡元亨之書法、葉進益的剪粘、陳玉峰的石雕等傳統匠師作品。
「高雄代天宮」廟體建築採華南式廟宇造型，「重檐歇山式」廟頂，剪粘裝飾各適其所。 三川步口，龍柱擎立，壁堵雕飾巧奪天工，石獅石礎，鐫刻有力，氣勢雄渾，龍虎呈祥，引人入勝。
