埔里祈安清醮為大埔里地區流傳已久的一項文化傳統，自二十世紀初葉祭典發軔以來，依循傳統每逢子年辦清醮，並在卯年辦理三獻清醮(醮尾)，祭典儀式規模盛大，且世代相傳百年以上。 目前可見的歷史相關史料，有大正13年的醮壇老照片及昭和11年醮壇老照片及相關文獻紀錄，由此顯示，埔里祈安清醮祭典創始至今至少將近有百年未曾間斷。除了逢子年辦理清醮，自民國41年起，再逢卯年再舉行三獻清醮(醮尾)。

這項有百年傳承的祭典，由地方大廟恆吉宮媽祖廟擔任總壇綜理醮局，下設東、南、西、北四大柱醮壇及63座分壇，醮區含括埔里鎮全境33里及仁愛鄉2村，參與人數達十萬左右。根據上一科清醮當時的統計，境內繳納丁口錢家戶高達75%，顯示這場清醮祭典充分獲得社群所認同，全境於建醮期間嚴守茹素的習俗早已約定成俗，如此12年一次的建醮、再逢卯年辦理三醮的祈安清醮祭典百年傳承，綜觀全台極為罕見。