林園鳳芸宮主祀天上聖母，長期以來與臺南安平地區的廟宇之間有所往來，並以海上巡香遶境方式（以漁船搭載神轎，組成龐大船隊）至臺南安平地區（靈濟殿及開臺天后宮）會香。海上巡香以四年一科方式舉辦，為林園地區與臺南安平地區，農曆三月重要的宗教民俗活動之一，形成極具地方文化特色的民俗活動。海巡路線繞行西南沿海，途經林園、中芸、紅毛港、旗津、左營、蚵仔寮、彌陀、永安、茄萣、臺南安平等地，沿岸友好宮廟皆燃放煙火迎接，具有跨地域特色，彰顯在地活力與向心力，為國內目前最大之海上巡香民俗活動。